2006年5月，国务院公布跨湖桥遗址为第六批全国重点文物保护单位。为更好地展示跨湖桥文化，萧山区决定建立跨湖桥遗址临时陈列馆。建设工程前期工作于2005年11月初开始，2006年4月20日正式开馆，次年6月闭馆，其间共接待游客34000余人次。

　　2009年9月28日，投资1亿元、历时2年多时间建成的跨湖桥遗址博物馆正式开馆。10月，跨湖桥遗址出土的独木舟和榫木构件入选“中华文明之最”。

　　2010年、2011年萧山区委、区政府连续主办两届中国国际（萧山）跨湖桥文化节，并在文化节期间组织了两次国际性学术研讨会。来自中国、美国、德国、澳大利亚、韩国、波利尼西亚等国家的数百名专家学者，围绕“跨湖桥文化研究的回顾与进展”、“跨湖桥独木舟与世界舟船文化”以及“东南地区史前文化研究对比”等主题展开学术报告和主题演讲，对东方远古文明与海洋的关系进行了进一步的挖掘和探讨。跨湖桥文化从此声名远播。