宁波港是长三角除上海港外为数不多拥有远洋航线的港口之一，2004年吞吐量就已居我国大陆第二位；集装箱400万箱，居我国大陆第四位，且增长率连续7年保持第一。同时，舟山港吞吐量2004年居我国大陆第九位。

　　2005年11月，交通部函复浙江省同意按照《港口法》的规定，由浙江省政府批准“宁波—舟山港”名称，宁波、舟山两港一体化迈出实质性的一步。我省成立宁波—舟山港一体化工作领导小组，以协调解决一体化进程中的重大问题。

　　2006年1月1日起，“宁波—舟山港”名称正式启用，宁波—舟山港管理委员会同时成立。

　　到2007年底，宁波—舟山港已拥有万吨级以上深水泊位84个，是中国大陆大型和特大型深水泊位最多的港口。2007年，宁波—舟山港共完成货物吞吐量4.73亿吨，位居世界港口第三位、全国第二位；完成集装箱943.1万标准箱，位居全国第四。

　　2008年7月18日，《宁波—舟山港总体规划》通过国家交通运输部和浙江省政府组织的联合评审。根据规划，未来5年宁波—舟山港将发展成为世界顶级货港。

　　随着杭州湾跨海大桥的建成，宁波—舟山港与上海港相通，从而串起了长江出海口江海连运“T”字型的黄金海岸，组成中国乃至世界最大的港口群。

　　2009年，宁波—舟山港货物吞吐量超过5.77亿吨。

　　2010年8月，宁波、舟山两地合作、统一开发的第一个港口项目——金塘大浦口集装箱码头一阶段2个泊位建成并投入生产。

　　2011年宁波—舟山港的货物吞吐量高达6.9亿吨，居世界沿海港口之最。