在洪都拉斯政变后，美国官员很快表态说，“美国只承认宪法选举产生的总统”。奥巴马总统6月29日在会见哥伦比亚总统乌里韦后也明确“发话”：洪都拉斯的政变是非法的，如果不彻底扭转这种局面，它将为军队制造政权更迭提供“可怕的先例”。奥巴马还承诺将与美洲国家组织和其他国际组织合作，使塞拉亚重新回国执政。

　　然而，尽管奥巴马政府在洪都拉斯政变的问题上表现得小心翼翼，美国政府也否认与政变有任何联系，但美国要想完全撇清与政变的干系却不那么容易。

　　一方面，美国与洪都拉斯军方关系密切。目前，五角大楼在洪都拉斯驻有近500名士兵。美国还帮助洪都拉斯培训军队。另一方面，洪都拉斯的经济高度依赖美国的援助，美国对洪都拉斯政策的影响力是显而易见的。

　　美国方面也承认，早在政变发生几周前，美国一直在“努力工作”以防止塞拉亚总统与军方之间发生政治危机。由于美国与洪都拉斯军方保持密切关系，美国是否对一场迫近的军事政变采取“睁一只眼闭一只眼”的态度，外界无从知晓。