“原生态文化”因是较少被现代文明冲击或保持着较多原始生活习俗或民风的文化形态，因此具有原创性、独特性等特征，对其保护与开发是我们义不容辞的责任。但因许多原生态文化带有民族民间口耳相传的特性，对其保护与开发存在著作权的纷争，此外因当前文化的商品化倾向日益浓厚，原生态文化有被撕为“文化碎片”的趋势。

　　对原生态文化的保护，综合起来，主要存在三方面的困惑：一是原生态文化保护方式上的困惑。原生态文化的许多表现形式，如歌舞、诗歌、技艺、风俗等存在口耳相传的传统。这一流传习俗客观上给其保护带来一定困难。二是原生态文化著作权的保护及其把握“度”上的困惑。一方面，原生态文化许多艺术形式是活生生流布于民间的东西，我们往往忽略了其著作权的问题；另一方面，原生态文化是活生生的文化，在以往的保护方式上都往往给予其“博物馆式”的封闭保护，认为若仅给原生态文化以较低层次的保护可能会引起它们变异，而最终失去其“纯度”。三是原生态文化如何鉴定的困惑。